Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms