Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms