Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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H2AFJQ9BTM1 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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H2AFJQ9BTM1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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H2AFJQ9BTM1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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H2AFJQ9BTM1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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H2AFJQ9BTM1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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H2AFJQ9BTM1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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H2AFJQ9BTM1 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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H2AFJQ9BTM1 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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H2AFJQ9BTM1 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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H2AFJQ9BTM1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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