Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms