Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FYCO1Q9BQS8 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms