Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PKP4Q99569 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PKP4Q99569 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PKP4Q99569 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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PKP4Q99569 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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PKP4Q99569 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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PKP4Q99569 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PKP4Q99569 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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PKP4Q99569 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PKP4Q99569 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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