Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms