Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms