Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms