Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms