Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECHDC3Q96DC8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECHDC3Q96DC8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECHDC3Q96DC8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECHDC3Q96DC8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECHDC3Q96DC8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ECHDC3Q96DC8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECHDC3Q96DC8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECHDC3Q96DC8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECHDC3Q96DC8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECHDC3Q96DC8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECHDC3Q96DC8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECHDC3Q96DC8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECHDC3Q96DC8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ECHDC3Q96DC8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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