Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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USP9XQ93008 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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USP9XQ93008 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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USP9XQ93008 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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USP9XQ93008 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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USP9XQ93008 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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USP9XQ93008 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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