Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms