Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LNX2Q8N448 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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