Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms