Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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UBE2Q1Q7Z7E8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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UBE2Q1Q7Z7E8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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UBE2Q1Q7Z7E8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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UBE2Q1Q7Z7E8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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UBE2Q1Q7Z7E8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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UBE2Q1Q7Z7E8 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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UBE2Q1Q7Z7E8 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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UBE2Q1Q7Z7E8 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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