Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SNX20Q7Z614 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SNX20Q7Z614 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SNX20Q7Z614 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SNX20Q7Z614 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SNX20Q7Z614 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SNX20Q7Z614 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SNX20Q7Z614 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SNX20Q7Z614 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SNX20Q7Z614 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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