Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms