Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms