Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TNS2-210ENST00000549700 4525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 CAMTA2-202ENST00000361571 4777 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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COL5A1-AS1Q5SY13 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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COL5A1-AS1Q5SY13 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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COL5A1-AS1Q5SY13 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 APOL3-205ENST00000397293 2214 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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COL5A1-AS1Q5SY13 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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COL5A1-AS1Q5SY13 SYNPO-202ENST00000394243 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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COL5A1-AS1Q5SY13 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 BCKDK-204ENST00000394951 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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