Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDLIM3Q53GG5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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