Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYTL3Q4VX76 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYTL3Q4VX76 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms