Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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