Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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