Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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