Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK5Q16478 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms