Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms