Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
JMJD1CQ15652 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms