Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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TAF1AQ15573 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TAF1AQ15573 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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