Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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UBE3CQ15386 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
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UBE3CQ15386 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
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UBE3CQ15386 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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UBE3CQ15386 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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