Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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