Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms