Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHPRHQ149N8 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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