Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms