Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms