Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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