Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 WNT16-202ENST00000361301 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ADAM10-203ENST00000402627 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC005726.6-201ENST00000579019 1083 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC010615.2-205ENST00000599993 929 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LINC02006-202ENST00000492569 1958 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 RBM5-AS1-201ENST00000630404 1386 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC104123.1-203ENST00000513158 575 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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