Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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