Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RPA4Q13156 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RPA4Q13156 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RPA4Q13156 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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