Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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CHAF1BQ13112 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHAF1BQ13112 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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