Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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