Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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