Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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BNIP1Q12981 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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BNIP1Q12981 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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BNIP1Q12981 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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BNIP1Q12981 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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BNIP1Q12981 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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BNIP1Q12981 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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BNIP1Q12981 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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BNIP1Q12981 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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BNIP1Q12981 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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