Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FOXD4Q12950 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FOXD4Q12950 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FOXD4Q12950 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FOXD4Q12950 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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FOXD4Q12950 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FOXD4Q12950 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FOXD4Q12950 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FOXD4Q12950 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FOXD4Q12950 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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