Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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FOXF1Q12946 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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FOXF1Q12946 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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FOXF1Q12946 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FOXF1Q12946 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FOXF1Q12946 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FOXF1Q12946 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FOXF1Q12946 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FOXF1Q12946 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FOXF1Q12946 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FOXF1Q12946 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FOXF1Q12946 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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