Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms