Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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