Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms