Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMSAP2Q08AD1 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMSAP2Q08AD1 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMSAP2Q08AD1 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMSAP2Q08AD1 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMSAP2Q08AD1 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMSAP2Q08AD1 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMSAP2Q08AD1 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMSAP2Q08AD1 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMSAP2Q08AD1 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMSAP2Q08AD1 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMSAP2Q08AD1 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMSAP2Q08AD1 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMSAP2Q08AD1 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMSAP2Q08AD1 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMSAP2Q08AD1 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMSAP2Q08AD1 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMSAP2Q08AD1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMSAP2Q08AD1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMSAP2Q08AD1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMSAP2Q08AD1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMSAP2Q08AD1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms