Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms